2117年未来东京怪人二十面相与明智侦探的战斗，历经7代后仍在继续。7代目小林少年所率领的少年侦探团，也仍然适度地将惊险的动作冒险夹杂在日常当中，悠然地度过每一天。但此时某个人物“怪人二十面相”却隐藏着恐怖的阴谋……。究竟7代目小林少年与7代目明智小五郎能否阻止怪人二十面相的暴走呢？