圣诞之夜，卡森共和国水企业和哈里曼达拉公司签订协议的大厦门外，无数群众声讨抗议而就在此时，担任护卫的警察机动部队突然掏枪对示威群众展开无差别屠杀血腥恐怖的事件背后，神秘病毒“火种”若隐若现在与不明敌人对决过程中，草薙素子和独立机动部队的同伴们救下了全身义体的少女津田艾玛，其身上似乎隐藏着利用虚拟记忆进行恐怖活动的事实。公安9课课长荒卷大辅拒绝将其交给陆军情报部穗积上校，而是命令草薙将艾玛护送至501机关接受调查。草薙在少女身上不仅发现两个灵魂的存在，更触摸到了被官方、军方可以隐藏的悲惨真相……　　本片根据士郎正宗的原作改编，为攻壳机动队前传“ARISE”的第四部。